自从普鲁士完成对德国的统一之后，德国首都就一直在柏林，直到年德国被苏联和美英苏分裂成东德和西德两个国家，由于柏林位于东德境内，因此西德将首都设在了波恩。
（波恩和柏林）
其实柏林城并不是完全属于东德，作为纳粹德国的首都，在二战结束后柏林城也是被美英法苏四国分区占领，此后英美法三国的占领区合并为西柏林，在两德分裂之后西柏林城还是属于西德的。
只不过西柏林完全是西德在东德的飞地，四周都被东德包围，与西德的交通不便，况且也不安全，毕竟当时东德和西德分属于不同阵营，一旦美苏开战，西柏林分分钟被干掉，因此西德没有在西柏林设都。
除了柏林以外德国还有许多名城，但在几经考虑之后西德政府还是将政府所在地设在了莱茵河畔的小城波恩。
波恩是一座历史悠久的城市，曾是科隆选帝侯国的都城，文化底蕴是很浓厚的。而且这里位于德国的最西边，万一苏军入侵西德，波恩有较大的战略缓冲区，不至于一开战首都就被端了。再者这里距离比利时和荷兰都很近，战时可以得到北约盟国的及时支援。
综合各种因素，西德政府将首都设在波恩主要是考虑安全因素，冷战时期西德可是地处美苏争霸的最前沿，搞不好三战就在德国率先打响，所以必须要找个安全的地方定都。
年10月3日两德完成统一，这是继年普鲁士完成统一后德国第二次统一，然而对统一之后的首都选址，各方的争议却非常大。
东德在合并的时候强烈希望依旧将首都设在柏林，但西德各州的反对声音很大，反对者认为波恩作为首都已经有40年的历史了，西德人对波恩的认同度是很高的，如果迁都的话必然会牵一发而动全身。
并且柏林在东德的统治下比较落后，各种基础设施都不完备，如果迁都肯定要大兴土木，花费巨大，而西德为了统一已经花了不少钱了，不宜再为迁都一事花费大笔资金。
反对者的理由虽然是有些道理，但主要原因还是在于当时东西两德之间的隔阂，毕竟两德分裂超过40年，经济发达的西德人比较歧视东德人，西德人不愿意将首都定在一个被苏联人统治过的城市。
（从这张图上可以看到，德国大公司主要分布在西德，直到现在这一局面仍旧没有多少改观）
但是支持还都柏林的人认为德国自从统一之后就建都柏林，还都柏林之举可以昭示两德统一壮举。并且建都柏林可以更好的支援东德地区的经济发展，缩小东德与西德之间的经济差距。
为此在年6月21日，德国议会就新首都问题进行投票，最后以票赞成，票反对的结果通过了迁都柏林的议案。
在之后的十年中，联邦政府的各个机构开始陆续从波恩迁往柏林，到年底德国政府的各主要机构都搬到了柏林，但是波恩依旧保留了有6个联邦部门，包括国防部都还留在波恩。时至今日，波恩仍是德国的第二大政治中心。
（位于波恩的德国国防部大楼，之所以仍将国防部设在波恩，还是出于国防安全的考虑）
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